진학어플라이 접수한 원서 목록에 없다면 결제처리가 안된것으로 보입니다.
qr 찍고 그뒤 클릭해줘야 결제가 완료되는데 그 부분을 스킵하신거 같습니다.
(평소 사용할 때 저도 겪었던 문제라 그럴 가능성이 높아 보입니다.)
해당 시간대에 결제 승인 문자가 안왔다면 결제 처리가 안된겁니다.